昨日,納米孔基因測序上游企業(yè)齊碳科技發(fā)布了即將量產(chǎn)的納米孔基因測序儀QNome-3841,以及配套芯片和試劑,并宣布其位于成都天府國際生物城的生產(chǎn)基地竣工。
而隨著全新納米孔基因測序儀的量產(chǎn),納米孔測序技術將在更多應用場景中發(fā)揮效用,為生命科學及相關領域的研究及應用提供解決方案。
據(jù)齊碳科技聯(lián)合創(chuàng)始人兼首席科學家白凈衛(wèi)博士表示:QNome-3841定位為一款小通量測序儀,8小時可產(chǎn)出1-1.5Gb數(shù)據(jù),單次準確率達90%,一致性準確率(50x)達99.9%,公司內(nèi)部已使用此款設備完成了讀長大于300Kb的測序?qū)嶒灐4送猓琎Nome-3841還能為用戶提供一站式數(shù)據(jù)分析平臺。
QNome-3841
據(jù)他介紹,這款產(chǎn)品因直接測序、實時、小巧便攜等特點,特別適合小型實驗室、戶外及對時效性要求高的應用場景,“例如臨床應用時,可以做到來一個樣本測一個樣本,無需湊樣,可大大縮短測序時間”。
另外,白凈衛(wèi)博士還透露了齊碳科技過去一年里在納米孔蛋白、生物芯片等核心技術方面取得的突破,譬如最新一代自主研發(fā)的K2系列納米孔蛋白,在沒有進行basecall算法的優(yōu)化下,單次準確率已達到95%;此外研發(fā)了基于有機基材和硅基材的兩種流體芯片,耗材可拆卸,能有效降低測序成本,同時還完成了自主ASIC芯片設計,全流程國產(chǎn)化生產(chǎn)。
在此之前的2020年9月,齊碳科技發(fā)布了自主研發(fā)的納米孔單分子基因測序儀,基于該產(chǎn)品的Alpha Test今年5月正式啟動。
齊碳科技聯(lián)合創(chuàng)始人謝丹博士表示,在Alpha Test階段,齊碳科技與病原體研究、遺傳病研究、腫瘤研究、司法刑偵、動植物保護等領域的頭部企業(yè)、高校、科研院所等多家機構開展合作,涉及70多個項目,1500多個樣本。項目涵蓋土壤宏基因組測序、疾病檢測、物種鑒定、基因組組裝、病毒分型、臨床病原檢測等。
在這些合作項目中,通過利用納米孔基因測序儀QNome-9604對大量細菌、病毒和人類基因組樣本進行測序,已累計輸出800Gb數(shù)據(jù)。而這些數(shù)據(jù)也為將來更多的創(chuàng)新研究,提供有力支撐。
據(jù)謝丹博士介紹,在Alpha Test階段,“單張芯片的最大孔數(shù)為325、最大數(shù)據(jù)量產(chǎn)出為1420Mb、最大N50為36Kb,最長reads為290Kb。這也意味著QNome-9604產(chǎn)品的性能和可靠性符合預期,可以滿足下游應用端用戶的需求。”
Alpha Test階段相關數(shù)據(jù)
隨后,他還分享了Alpha Test階段在血流感染宏基因組檢測、細菌基因組組裝、法醫(yī)領域SNP位點測序、腫瘤融合基因檢測等6個典型案例,展現(xiàn)了納米孔基因測序技術在多個應用場景中的優(yōu)勢和廣闊的市場前景。
以法醫(yī)領域為例來看,四川大學華西基礎醫(yī)學與法醫(yī)學院侯一平教授就指出,全球法醫(yī)實驗室廣泛使用DNA檢測來偵破刑事案件。DNA測序?qū)π蛄薪Y構解析的優(yōu)勢有益于法醫(yī)DNA分析。便攜的納米孔測序儀更加適用于犯罪現(xiàn)場分析,近來也逐漸在法醫(yī)領域嶄露頭角。
最后,齊碳科技CEO胡庚博士表示,“當前的技術和產(chǎn)品僅僅是一個開始,未來齊碳將不斷加速技術、產(chǎn)品和場景的探究步伐,為用戶提供各個場景下‘從樣本到結果’的基因測序解決方案。”
36氪獨家|攻克基因測序“卡脖子”技術,齊碳科技獲超4億元B輪融資,鼎暉、高瓴聯(lián)合領投